MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Agrobacterium vitis S4 chromosome 1

Total Repeats: 64128

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011989	A	6	6	214	219	100 %	0 %	0 %	0 %	222147016
2	NC_011989	CTT	2	6	220	225	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222147016
3	NC_011989	GCA	2	6	281	286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147016
4	NC_011989	CCG	2	6	343	348	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147016
5	NC_011989	CAAT	2	8	368	375	50 %	25 %	0 %	25 %	222147016
6	NC_011989	TGA	2	6	552	557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222147016
7	NC_011989	ATT	2	6	564	569	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222147016
8	NC_011989	GAT	2	6	608	613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222147016
9	NC_011989	CGT	2	6	646	651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147016
10	NC_011989	ATCT	2	8	692	699	25 %	50 %	0 %	25 %	222147016
11	NC_011989	GAA	2	6	902	907	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222147016
12	NC_011989	TG	3	6	927	932	0 %	50 %	50 %	0 %	222147016
13	NC_011989	GCG	2	6	986	991	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147016
14	NC_011989	CCG	2	6	1094	1099	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147017
15	NC_011989	CGC	2	6	1195	1200	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147017
16	NC_011989	CGG	2	6	1274	1279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147017
17	NC_011989	GC	3	6	1387	1392	0 %	0 %	50 %	50 %	222147017
18	NC_011989	GGC	2	6	1423	1428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147017
19	NC_011989	TGG	2	6	1523	1528	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222147017
20	NC_011989	GTT	2	6	1556	1561	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222147017
21	NC_011989	TCG	2	6	1570	1575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147017
22	NC_011989	TCG	2	6	1591	1596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147017
23	NC_011989	TGCA	2	8	1645	1652	25 %	25 %	25 %	25 %	222147017
24	NC_011989	TTG	2	6	1685	1690	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222147018
25	NC_011989	TTC	2	6	1807	1812	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222147018
26	NC_011989	GGT	2	6	1846	1851	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222147018
27	NC_011989	GGC	2	6	1875	1880	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147018
28	NC_011989	TGG	2	6	1907	1912	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222147018
29	NC_011989	GGC	2	6	1926	1931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147018
30	NC_011989	CCA	2	6	1967	1972	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222147018
31	NC_011989	GTG	2	6	2060	2065	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222147018
32	NC_011989	GCA	2	6	2106	2111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147018
33	NC_011989	TGT	2	6	2118	2123	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222147018
34	NC_011989	AG	3	6	2191	2196	50 %	0 %	50 %	0 %	222147018
35	NC_011989	AGG	2	6	2204	2209	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222147018
36	NC_011989	CGC	2	6	2330	2335	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147018
37	NC_011989	TTG	2	6	2347	2352	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222147018
38	NC_011989	GCG	2	6	2365	2370	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147018
39	NC_011989	GAT	2	6	2461	2466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222147018
40	NC_011989	TTG	2	6	2476	2481	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222147018
41	NC_011989	AGC	2	6	2498	2503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147018
42	NC_011989	GAT	2	6	2504	2509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222147018
43	NC_011989	ACG	2	6	2550	2555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147019
44	NC_011989	T	7	7	2561	2567	0 %	100 %	0 %	0 %	222147019
45	NC_011989	ATG	2	6	2590	2595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222147019
46	NC_011989	GCG	2	6	2601	2606	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147019
47	NC_011989	AAC	2	6	2734	2739	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222147019
48	NC_011989	GGCG	2	8	2804	2811	0 %	0 %	75 %	25 %	222147019
49	NC_011989	GTT	2	6	2820	2825	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222147019
50	NC_011989	GCT	2	6	2837	2842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147019
51	NC_011989	CGG	2	6	2852	2857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147019
52	NC_011989	GTC	2	6	2883	2888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147019
53	NC_011989	GAA	2	6	2943	2948	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222147019
54	NC_011989	GC	3	6	2993	2998	0 %	0 %	50 %	50 %	222147019
55	NC_011989	AAT	2	6	3183	3188	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222147020
56	NC_011989	ACC	2	6	3214	3219	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222147020
57	NC_011989	AAGC	2	8	3228	3235	50 %	0 %	25 %	25 %	222147020
58	NC_011989	TCG	2	6	3404	3409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147020
59	NC_011989	T	6	6	3423	3428	0 %	100 %	0 %	0 %	222147020
60	NC_011989	GTC	2	6	3503	3508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147020
61	NC_011989	GGCGC	2	10	3549	3558	0 %	0 %	60 %	40 %	222147020
62	NC_011989	CTCG	2	8	3579	3586	0 %	25 %	25 %	50 %	222147020
63	NC_011989	GCC	2	6	3692	3697	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147020
64	NC_011989	GCC	2	6	3778	3783	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147020
65	NC_011989	GCGTC	2	10	3799	3808	0 %	20 %	40 %	40 %	222147020
66	NC_011989	GACCC	2	10	3983	3992	20 %	0 %	20 %	60 %	222147021
67	NC_011989	ATCG	2	8	4031	4038	25 %	25 %	25 %	25 %	222147021
68	NC_011989	GATC	2	8	4039	4046	25 %	25 %	25 %	25 %	222147021
69	NC_011989	GCG	2	6	4051	4056	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147021
70	NC_011989	GAT	2	6	4085	4090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222147021
71	NC_011989	GC	3	6	4094	4099	0 %	0 %	50 %	50 %	222147021
72	NC_011989	CGC	2	6	4180	4185	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147021
73	NC_011989	TCA	2	6	4221	4226	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222147021
74	NC_011989	CGG	2	6	4234	4239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147021
75	NC_011989	GAGC	2	8	4334	4341	25 %	0 %	50 %	25 %	222147021
76	NC_011989	GCG	2	6	4342	4347	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147021
77	NC_011989	AT	3	6	4377	4382	50 %	50 %	0 %	0 %	222147021
78	NC_011989	GAG	2	6	4568	4573	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222147022
79	NC_011989	GAT	2	6	4615	4620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222147022
80	NC_011989	TGA	2	6	4648	4653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222147022
81	NC_011989	GCCA	2	8	4677	4684	25 %	0 %	25 %	50 %	222147022
82	NC_011989	CGCC	2	8	4691	4698	0 %	0 %	25 %	75 %	222147022
83	NC_011989	TGA	2	6	4725	4730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222147022
84	NC_011989	AGC	2	6	4766	4771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147022
85	NC_011989	TGA	2	6	4788	4793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222147022
86	NC_011989	CCG	2	6	4817	4822	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147022
87	NC_011989	GGC	2	6	4855	4860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147022
88	NC_011989	AGG	2	6	4931	4936	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222147022
89	NC_011989	CCAGCG	2	12	4959	4970	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	222147022
90	NC_011989	CT	3	6	5205	5210	0 %	50 %	0 %	50 %	222147023
91	NC_011989	TGG	2	6	5217	5222	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222147023
92	NC_011989	GCGTA	2	10	5248	5257	20 %	20 %	40 %	20 %	222147023
93	NC_011989	CAG	2	6	5328	5333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147023
94	NC_011989	GTC	2	6	5348	5353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147023
95	NC_011989	GC	3	6	5501	5506	0 %	0 %	50 %	50 %	222147023
96	NC_011989	CTG	2	6	5567	5572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147023
97	NC_011989	AGC	2	6	5619	5624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147023
98	NC_011989	GCG	2	6	5625	5630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147023
99	NC_011989	TGA	2	6	5634	5639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222147023
100	NC_011989	GTG	2	6	5882	5887	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222147024
101	NC_011989	CGA	2	6	5891	5896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147024
102	NC_011989	GAT	2	6	5947	5952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222147024
103	NC_011989	CAC	2	6	5997	6002	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222147024
104	NC_011989	CCGGC	2	10	6015	6024	0 %	0 %	40 %	60 %	222147024
105	NC_011989	GCT	2	6	6057	6062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147024
106	NC_011989	CTG	2	6	6112	6117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147024
107	NC_011989	GCAC	2	8	6145	6152	25 %	0 %	25 %	50 %	222147024
108	NC_011989	ATC	2	6	6209	6214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222147024
109	NC_011989	CCG	2	6	6243	6248	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147024
110	NC_011989	GATC	2	8	6261	6268	25 %	25 %	25 %	25 %	222147024
111	NC_011989	GCG	2	6	6332	6337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147024
112	NC_011989	TTA	2	6	6342	6347	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222147024
113	NC_011989	G	6	6	6532	6537	0 %	0 %	100 %	0 %	222147024
114	NC_011989	TCC	2	6	6561	6566	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222147024
115	NC_011989	CGC	2	6	6702	6707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147024
116	NC_011989	TGG	2	6	6722	6727	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222147024
117	NC_011989	TCAT	2	8	6782	6789	25 %	50 %	0 %	25 %	222147024
118	NC_011989	TTG	2	6	6881	6886	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222147024
119	NC_011989	GC	3	6	6892	6897	0 %	0 %	50 %	50 %	222147024
120	NC_011989	GTCGA	2	10	7003	7012	20 %	20 %	40 %	20 %	222147024
121	NC_011989	GC	3	6	7077	7082	0 %	0 %	50 %	50 %	222147025
122	NC_011989	ACC	2	6	7083	7088	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222147025
123	NC_011989	GCC	2	6	7179	7184	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147025
124	NC_011989	CTCG	2	8	7193	7200	0 %	25 %	25 %	50 %	222147025
125	NC_011989	CCG	2	6	7207	7212	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147025
126	NC_011989	GAA	2	6	7226	7231	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222147025
127	NC_011989	CCA	2	6	7244	7249	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222147025
128	NC_011989	CG	3	6	7282	7287	0 %	0 %	50 %	50 %	222147025
129	NC_011989	CAAGCT	2	12	7289	7300	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	222147025
130	NC_011989	GC	3	6	7370	7375	0 %	0 %	50 %	50 %	222147025
131	NC_011989	ATC	2	6	7404	7409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222147025
132	NC_011989	TTC	2	6	7499	7504	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222147025
133	NC_011989	CAT	2	6	7521	7526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222147025
134	NC_011989	CGG	2	6	7529	7534	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147025
135	NC_011989	GC	3	6	7540	7545	0 %	0 %	50 %	50 %	222147025
136	NC_011989	GC	3	6	7560	7565	0 %	0 %	50 %	50 %	222147025
137	NC_011989	ACGG	2	8	7710	7717	25 %	0 %	50 %	25 %	222147026
138	NC_011989	CAT	2	6	7768	7773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222147026
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143	NC_011989	CTG	2	6	7987	7992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147026
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150	NC_011989	GTGACC	2	12	8353	8364	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	222147027
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251	NC_011989	CAA	2	6	15031	15036	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222147032
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253	NC_011989	GGAT	2	8	15132	15139	25 %	25 %	50 %	0 %	222147032
254	NC_011989	TTC	2	6	15143	15148	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222147032
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257	NC_011989	GACC	2	8	15339	15346	25 %	0 %	25 %	50 %	222147033
258	NC_011989	CGG	2	6	15428	15433	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147033
259	NC_011989	TGG	2	6	15438	15443	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222147033
260	NC_011989	CGA	2	6	15465	15470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147033
261	NC_011989	CAA	2	6	15498	15503	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222147033
262	NC_011989	CTG	2	6	15520	15525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147033
263	NC_011989	GCT	2	6	15684	15689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147033
264	NC_011989	CTA	2	6	15786	15791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222147033
265	NC_011989	GAT	2	6	15879	15884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222147033
266	NC_011989	GCC	2	6	15896	15901	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147033
267	NC_011989	TGG	2	6	15914	15919	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222147033
268	NC_011989	CGG	2	6	15927	15932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147033
269	NC_011989	GAT	2	6	15970	15975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222147033
270	NC_011989	GAT	2	6	15987	15992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222147033
271	NC_011989	GGC	2	6	16006	16011	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147033
272	NC_011989	CTG	2	6	16090	16095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147033
273	NC_011989	ATT	2	6	16267	16272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222147033
274	NC_011989	TGA	2	6	16307	16312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222147033
275	NC_011989	GC	3	6	16314	16319	0 %	0 %	50 %	50 %	222147033
276	NC_011989	ATC	2	6	16342	16347	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222147033
277	NC_011989	TGA	2	6	16349	16354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222147033
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279	NC_011989	GCG	2	6	16497	16502	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147034
280	NC_011989	TCGC	2	8	16520	16527	0 %	25 %	25 %	50 %	222147034
281	NC_011989	CAT	2	6	16528	16533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222147034
282	NC_011989	GC	3	6	16630	16635	0 %	0 %	50 %	50 %	222147034
283	NC_011989	ATG	2	6	16718	16723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222147034
284	NC_011989	TCTATG	2	12	16740	16751	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	222147034
285	NC_011989	GAT	2	6	16769	16774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222147034
286	NC_011989	GTC	2	6	16805	16810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147034
287	NC_011989	CCG	2	6	16817	16822	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147034
288	NC_011989	TGCC	2	8	16841	16848	0 %	25 %	25 %	50 %	222147034
289	NC_011989	TGC	2	6	16920	16925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147034
290	NC_011989	TAT	2	6	16946	16951	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222147034
291	NC_011989	CGG	2	6	17070	17075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147034
292	NC_011989	CGT	2	6	17110	17115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147034
293	NC_011989	GAT	2	6	17162	17167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222147034
294	NC_011989	CGG	2	6	17175	17180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147034
295	NC_011989	GGT	2	6	17194	17199	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222147034
296	NC_011989	GCG	2	6	17223	17228	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147034
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299	NC_011989	GAA	2	6	17664	17669	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222147035
300	NC_011989	TGG	2	6	17759	17764	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222147035
301	NC_011989	CGT	2	6	17766	17771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147035
302	NC_011989	GGC	2	6	17791	17796	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147035
303	NC_011989	TGC	2	6	17808	17813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147035
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316	NC_011989	TCA	2	6	18458	18463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222147036
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320	NC_011989	GGC	2	6	18634	18639	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147036
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324	NC_011989	CTG	2	6	18826	18831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147036
325	NC_011989	GGGC	2	8	18876	18883	0 %	0 %	75 %	25 %	222147036
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354	NC_011989	GCCGA	2	10	20755	20764	20 %	0 %	40 %	40 %	222147037
355	NC_011989	TGGT	2	8	20829	20836	0 %	50 %	50 %	0 %	222147037
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358	NC_011989	GAC	2	6	21217	21222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147038
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378	NC_011989	GCC	2	6	22968	22973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147040
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380	NC_011989	GAT	2	6	23097	23102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222147040
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384	NC_011989	GGCCAA	2	12	23243	23254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147040
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386	NC_011989	TTG	2	6	23317	23322	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222147040
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388	NC_011989	CGGG	2	8	23418	23425	0 %	0 %	75 %	25 %	222147040
389	NC_011989	CGA	2	6	23426	23431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147040
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498	NC_011989	GCCAG	2	10	28585	28594	20 %	0 %	40 %	40 %	222147046
499	NC_011989	GCG	2	6	28693	28698	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147046
500	NC_011989	TGG	2	6	28834	28839	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222147046

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